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本重大研究计划面向我国深空探测任务重大需求，旨在科学认知并精确把控进入行星大气飞行的关键物理机理和效应，创新发展极端流动与传热理论，引领相关领域科学前沿和技术发展，支撑航天强国战略。项目资助类型包括培育项目、重点支持项目。
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针对关键软件自主创新的国家重大战略需求，为我国实现关键软件领域的科学突破提供基础理论、关键技术和人才支撑。国家自然科学基金委员会制定面向人机物融合的智能化软件基础研究重大研究计划。年度资助的研究方向包括培育项目、重点支持项目，直接费用资助强度约为80万/项、300万/项。
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本重大研究计划以深部挥发份的“催化作用”和新化学反应为切入点，围绕挥发份（重点关注碳-氢-氧）在地球内部的分布、循环和效应三个相互关联的核心科学问题开展研究。拟资助培育项目12项左右，直接费用资助强度约为80万/项；拟资助重点支持项目12项左右，直接费用资助强度约为300万/项。
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为我国RNA生物医药发展提供新机遇，确立我国在RNA研究领域的国际引领地位，国家自然科学基金委员会现发布赋能药物创新的RNA基础研究重大研究计划项目指南。资助研究方向包括培育项目、重点支持项目，直接费用资助强度约为80万元/项、300万元/项。
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破译生命的糖质密码重大研究计划面向人民生命健康，以“糖质密码（glycocode）”新视角，解析糖质序列结构与生物功能的复杂映射关系，拓展生命信息调控的机制和基本规律，布局从技术开发、功能阐释、精准调控到临床应用的创新体系，为我国在糖质相关的生物医药发展奠定基础。2025年度拟资助培育项目20～30项，直接费用资助强度约为80万元/项，资助期限为3年。
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为支持基础研究、坚持自由探索，国家自然科学基金按照资助类别可分为面上项目、重点项目、重大项目、重大研究计划、国家杰出青年科学基金、海外、港澳青年学者合作研究基金、创新研究群体科学基金、国家基础科学人才培养基金、专项项目、联合资助基金项目以及国际(地区)合作与交流项目等。通过亚类说明、附注说明还可将一些资助类别进一步细化。所有这些资助类别各有侧重，相互补充，共同构成当前的自然科学基金资助体系。
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为进一步提升我国对外科技创新合作的层次与水平，全面 推动各层面科技创新合作，科技部会同有关部门遵循国家重点研发计划项目形成机制，编制形成了国家重点研发计划政府间国 际科技创新合作/港澳台科技创新合作重点专项。设立 28 个指南方向，支持与 25 个国家、地区、国际组织和多边合作机制开展科技合作，拟支持项目数 317 个左右，国拨经费总概算 7.7 亿元。
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为深入贯彻落实国家《种业振兴行动方案》和中共中央办公厅、国务院办公厅印发的《关于进一步加强青年科技人才培养和使用的若干措施》，更好推进生物育种研究和人才培养，生命科学部设立“生物育种”研究青年专项、多年生稻驯化改良与利用的基础研究专项、生命过程分子语言逻辑结构的AI解析专项、衰老引发慢性炎症的共性机制研究专项。
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科技创新 2030—“量子通信与量子计算机”重大项目将在量子通信、量子计算与量子精密测量三 个领域部属公开竞争类项目，拟支持 13 个研究方向(每个方向原则上支持 1 个项目)，实施周期一般为 5 年。同时拟在上述三个领域支持青年科学家项目不超过 15 项，研究内容不受指南方向限制，实施周期一般为 5 年。
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为进一步提升我国对外科技创新合作的层次与水平，全面 推动各层面科技创新合作，科技部会同有关部门遵循国家重点研发计划项目形成机制，编制形成了国家重点研发计划政府间国 际科技创新合作/港澳台科技创新合作重点专项。设立 28 个指南方向，支持与 25 个国家、地区、国际组织和多边合作机制开展科技合作，拟支持项目数 317 个左右，国拨经费总概算 7.7 亿元。
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