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本重大研究计划旨在揭示细胞集群形成、可塑性与功能涌现的基本规律，塑造从技术开发、规律诠译、理论建立、到临床应用的创新体系，为我国在细胞集群可塑性机制研究与再生医学相关生物医药产业的发展奠定基础。资助研究方向包括培育项目、重点支持项目。
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本重大研究计划面向我国深空探测任务重大需求，旨在科学认知并精确把控进入行星大气飞行的关键物理机理和效应，创新发展极端流动与传热理论，引领相关领域科学前沿和技术发展，支撑航天强国战略。项目资助类型包括培育项目、重点支持项目。
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针对关键软件自主创新的国家重大战略需求，为我国实现关键软件领域的科学突破提供基础理论、关键技术和人才支撑。国家自然科学基金委员会制定面向人机物融合的智能化软件基础研究重大研究计划。年度资助的研究方向包括培育项目、重点支持项目，直接费用资助强度约为80万/项、300万/项。
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本重大研究计划以深部挥发份的“催化作用”和新化学反应为切入点，围绕挥发份（重点关注碳-氢-氧）在地球内部的分布、循环和效应三个相互关联的核心科学问题开展研究。拟资助培育项目12项左右，直接费用资助强度约为80万/项；拟资助重点支持项目12项左右，直接费用资助强度约为300万/项。
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为我国RNA生物医药发展提供新机遇，确立我国在RNA研究领域的国际引领地位，国家自然科学基金委员会现发布赋能药物创新的RNA基础研究重大研究计划项目指南。资助研究方向包括培育项目、重点支持项目，直接费用资助强度约为80万元/项、300万元/项。
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破译生命的糖质密码重大研究计划面向人民生命健康，以“糖质密码（glycocode）”新视角，解析糖质序列结构与生物功能的复杂映射关系，拓展生命信息调控的机制和基本规律，布局从技术开发、功能阐释、精准调控到临床应用的创新体系，为我国在糖质相关的生物医药发展奠定基础。2025年度拟资助培育项目20～30项，直接费用资助强度约为80万元/项，资助期限为3年。
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为支持基础研究、坚持自由探索，国家自然科学基金按照资助类别可分为面上项目、重点项目、重大项目、重大研究计划、国家杰出青年科学基金、海外、港澳青年学者合作研究基金、创新研究群体科学基金、国家基础科学人才培养基金、专项项目、联合资助基金项目以及国际(地区)合作与交流项目等。通过亚类说明、附注说明还可将一些资助类别进一步细化。所有这些资助类别各有侧重，相互补充，共同构成当前的自然科学基金资助体系。
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根据《国家重点研发计划管理暂行办法》(国科发资〔2024〕28号)相关要求，现将工业和信息化部主责的“十四五”国家重点研发计划“工业软件”“智能机器人”“增材制造与激光制造”“新能源汽车”“基础科研条件与重大科学仪器设备研发”“信息光子技术”“先进计算与新兴软件”共7个重点专项2025年度项目申报指南予以公布，请根据指南要求组织项目申报工作。
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国家自然科学基金委员会与香港研究资助局联合科研资助基金合作研究重点项目的设立背景是：根据国家自然科学基金委员会与香港研究资助局关于设立联合科研资助基金的协议，双方每年联合资助内地与香港科学技术人员开展合作研究。本项目资助由内地和香港科学技术人员联合提出的自然科学领域的研究计划，重点资助领域为信息科学、生物科学、新材料科学、海洋与环境科学、医学科学、管理科学等。直接费用资助强度不超过300万元人民币/项。
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国家自然科学基金委员会与香港研究资助局联合科研资助基金合作研究重点项目的设立背景是：根据国家自然科学基金委员会与香港研究资助局关于设立联合科研资助基金的协议，双方每年联合资助内地与香港科学技术人员开展合作研究。本项目资助由内地和香港科学技术人员联合提出的自然科学领域的研究计划，重点资助领域为信息科学、生物科学、新材料科学、海洋与环境科学、医学科学、管理科学等。直接费用资助强度不超过300万元人民币/项。
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