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为加强交叉科学发展战略顶层设计，促进交叉科学领域学术交流和科学传播等活动，专项项目(科技活动项目)用于资助与国家自然科学基金发展相关的战略与管理研究、学术交流活动、科学传播和科普平台建设等活动。包括以下3种类型：交叉科学领域发展战略与管理研究、对交叉科学发展有益的专题研讨会议、对交叉科学领域发展发挥正向宣传作用的科学传播和科普活动。
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国家重点研发计划颠覆性技术创新重点专项作为科技计划管理改革“试验田”，由京津冀国家技术创新中心作为承接专项具体管理的机构，创新科技攻关的组织模式和运行机制，加速培育颠覆技术创新，抢占科技战略制高点。专项定位于探索型、培育型专项，不设项目或课题指南。中心组建颠覆性技术创新网络，采取开放发现、常态选拔、及时立项、动态优化、滚动支持等机制实施专项。
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国家重点研发计划颠覆性技术创新重点专项作为科技计划管理改革“试验田”，由京津冀国家技术创新中心作为承接专项具体管理的机构，创新科技攻关的组织模式和运行机制，加速培育颠覆技术创新，抢占科技战略制高点。专项定位于探索型、培育型专项，不设项目或课题指南。中心组建颠覆性技术创新网络，采取开放发现、常态选拔、及时立项、动态优化、滚动支持等机制实施专项。
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2019年中国作为创始成员国正式签署SKA天文台公约，同期国务院批准科技部设立SKA专项，现开展平方公里阵列射电望远镜(SKA)专项项目申报。项目的组织实施应整合全国相关领域的优势创新团队，聚焦指南任务，强化基础研究、共性关键技术研发和典型应用示范各项任务间的统筹衔接，集中力量，联合攻关。
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为落实“国家重点研发计划有关部署安排，现启动实施“长江黄河等重点流域水资源与水环境综合治理”重点专项。申报单位应根据指南方向的研究内容以项目为单元整体组织申报，并覆盖相应指南方向的全部考核指标。项目负责人应聚焦指南任务，整合优势创新团队，并积极吸纳优秀青年和女性科研人员参与项目研发。鼓励有信心、有能力组织好关键核心技术攻坚的优势团队积极申报。
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中国创新创业大赛自2012年创办以来，以挖掘培养和服务科技创新企业为使命，不断激发市场主体创新活力，为科技创新企业提供了广阔的展示平台。大赛秉承“政府引导、公益支持、市场机制”的模式，引导、集聚政府和市场资源支持创新创业，激发全社会创新创业热情，扶持中小微企业创新发展。
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为实施更加开放包容、互惠共享的国际科技合作战略，国家自然科学基金委员会发起“可持续发展国际合作科学计划”，促进各国科研人员的双多边国际交流与合作，共同开展面向全球挑战的科学研究。本指南重点资助对干旱-半干旱地区社会-生态系统、泛青藏高原周边山地社会-生态系统、中国西南地区喀斯特社会-生态系统和滨海城市社会-生态系统动力学与可持续发展的综合性(或集成性)研究。“整体综合研究项目”资助强度为400万元/项(直接费用)。
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为攻克关键金属强化分离理论瓶颈，实现分离理论突破，围绕上述科学目标，国家自然科学基金委员会现发布战略性关键金属超常富集成矿动力学重大研究计划项目指南，开展集成项目类型资助。资助方向包括关键金属超常富集成矿理论突破、关键金属成矿规律与指导找矿突破等，最高直接费用资助强度约400万元/项。
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根据国务院印发的《关于深化中央财政科技计划(专项、基金等)管理改革的方案》(国发〔2014〕64 号)的总体部署，按照国家重点研发计划组织管理的相关要求，设立“战略性科技创新合作”重点专项。
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