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气象联合基金以需求和问题为导向，主要支持围绕气象高质量发展核心领域科学问题和技术难题，在区域数值预报模式、灾害性天气、气候变化、气象信息化新技术、环境气象条件保障等领域开展基础性、前沿性和创新性研究，旨在解决和突破一批与气象行业核心技术密切相关的关键科学问题，培养一批气象领域优秀科研人才和团队，夯实气象科技自立自强根基，推动广东及粤港澳大湾区气象事业高质量发展。
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水利联合基金注重需求牵引和问题导向，紧密结合水利科学服务国家及区域高质量发展的重大战略需求，重点支持水利行业优秀科研人员围绕解决影响和制约区域水安全保障的关键科学问题和技术方法，在水旱灾害防御、水网建设与运维、河湖治理与保护、水资源节约利用、数字孪生水利等领域开展基础性、前沿性和创新性研究，培养科研人才、促进学科发展，为我省水利科学和经济社会发展提供高质量的科技支撑。
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为落实省委省政府关于全面加强基础研究的部署要求，充分发挥省基础与应用基础研究基金导向作用，2025年省科技厅、省基础与应用基础研究基金委员与南沙区设立了联合基金，现启动广东省基础与应用基础研究基金南沙联合基金项目的组织申报工作。本年度南沙联合基金设立青年基金项目、地区培育项目、重点项目、粤港澳研究团队项目四类。
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粤穗联合基金是省基金的组成部分，按照“省市联合、立足区域、面向社会、公平竞争”的原则，围绕广州与粤港澳大湾区经济、社会、科技发展需求，支持在重点领域和方向开展基础与应用基础研究，培养青年科技人才和粤港澳研究团队，鼓励区域合作与协同创新，突破地方和产业创新发展的关键科学问题，促进一批主流学科进入国家乃至世界前列，提升原始创新能力和国际影响力，支撑粤港澳大湾区国际科技创新中心建设。
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围绕惠州与粤港澳大湾区经济、社会、科技发展需求，支持在重点领域和方向开展基础与应用基础研究，培养青年科技人才和粤港澳研究团队，鼓励区域合作与协同创新，突破地方和产业创新发展的关键科学问题，促进一批主流学科进入国家乃至世界前列，提升原始创新能力和国际影响力，支撑粤港澳大湾区国际科技创新中心建设。本年度粤惠联合基金设立青年基金项目、地区培育项目、重点项目三类。
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粤江联合基金按照“省市联合、立足区域、面向社会、公平竞争”的原则，围绕江门与粤港澳大湾区经济、社会、科技发展需求，支持在重点领域和方向开展基础与应用基础研究，培养青年科技人才和粤港澳研究团队，鼓励区域合作与协同创新，突破地方和产业创新发展的关键科学问题，促进一批主流学科进入国家乃至世界前列，提升原始创新能力和国际影响力，支撑粤港澳大湾区国际科技创新中心建设。
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